Κύρια αποστολή της Βιβλιοθήκης είναι η συντήρηση και φύλαξη των βιβλίων, περιοδικών, χειρογράφων, χαρτών και συλλογών (εκ νέου δωρεών ή αγορών) πού στεγάζονται στο Μέγαρο του Ιδρύματος και αποτελούν μέρος του βιβλιακού θησαυρού του Έθνους, καθώς και η βιβλιοθηκονομική επεξεργασία όλων των βιβλίων και περιοδικών της Κεντρικής Βιβλιοθήκης, των Κέντρων και Γραφείων της Ακαδημίας.