Η χωροθέτηση των Σχολών και των Τμημάτων του Πανεπιστημίου Αιγαίου σε πέντε νησιά καθόρισε την διάρθρωση και την φυσιογνωμία της (υπηρεσίας) βιβλιοθήκης η οποία προσέλαβε την μορφή δικτύου Βιβλιοθηκών, με Παραρτήματα στα νησιά όπου λειτουργούν μονάδες του Πανεπιστημίου Αιγαίου.
Η Βιβλιοθήκη φιλοδοξεί να άρει την γεωγραφική απομόνωση των νησιών παρέχοντας στους χρήστες της σύγχρονες υπηρεσίες πληροφόρησης.